ایما و اشاره ولایتی به مقام بلند پایه اجرایی به غیر از احمدی نژاد کس دیگری نمی توانست باشد. نماز جمعه ای هم که او در این باره سخنرانی کرده بود، جمعه 13 مهرماه سال 86 بود که مصادف با روز قدس هم بود. محمود احمدی نژاد در آن مراسم با اشاره به این که «از نظر ما ماجرای جنجالی هسته ای ایران خاتمه پیدا کرده است» گفت که «ما دیگر حاضر نیستیم که به عرصه سیاسی برویم و دربارة حقوق ملت ایران با برخی از قدرتها بنشینیم صحبت کنیم، به چه دلیل؟ ما یک عضو آژانس هستیم وحقوقی وتکالیفی داریم و تکالیفمان را کامل انجام دادیم. البته از حقوقمان کامل استفاده نکردیم.
او در ادامه به «بعضی ها» هم نصحیتی کرد و گفت که «بعضیها در داخل هستند که متأسفانه دستشان به رسانه يا جایی بند است. اینها یا از روی ترس که برخی از این جنجالهای قدرتهای غربی را خیلی جدی حساب می کنند یا از روی موضوعات دیگری ناراحت اند. ناراحت هستند که مسئله هسته ای ایران این طور به فضل الهی به نفع ملت ایران حل شده است. ناراحت اند و می خواهند بی جهت در مسئله دخالت کنند. راه افتاده اند می گویند ما می خواهیم برای حل بن بست هسته ای راه حل بدهیمکدام بن بست هسته ای؟ چه کسی در بن بست است؟ دنیا بداند ملت ایران این ملت الهی هیچ گاه بن بست نداشته استاحمدی نژاد در ادامه سخنی گفت که بسیاری از رسانه ها با همان تیتر سراغ انعکاس آن سخنرانی رفتند: عده ای سرخود مذاکره می کنند! او گفت که « شما میخوهید آنها را از بن بست در بیارید؛ ملت ایران که در بن بست نیست، یا عده ای احساس مسئولیت کنند و سرخود بلند شوند بروند بخواهند با آنها مذاکره کنند، آنها هم استقبال کنند...»وي خبر داد كه سعيد جليلي جايگزين علي لاريجاني خواهد شداستعفای لاریجانی در آن مقطع در حالی مطرح شد که چند روز قبل تر ولادیمیر پوتین به ایران آمده و لاریجانی اعلام کرده بود که پوتین پیشنهادی هسته ای به رهبر انقلاب ارائه داده است. این گفته هم با واکنش محمود احمدی نژاد همراه شد و گفت که «هيچ پيشنهاد هستهاي مطرح نبود بلكه پوتین پيام دوستي و همكاري همه جانبه را آورده بود كه ما نيز پيام ادامه همكاريها و تاكيد بر اراده جدي بر عملي شدن توافقات را داشتيمدو هفته بعد از این سخنرانی غلامحسین الهام سخنگوی دولت در یکی از نشست های خبری خود از استعفای علی لاریجانی رایزن هسته ای کشورمان خبر داد و گفت که لاريجاني بارها استعفا كرده بود و سرانجام رييس جمهوري استعفاي وي را پذيرفت.
چند روز قبل علی لاریجانی بعد از شش سال دلیل استعفای خود را بیان کرده و گفته بود که «من حس می کردم یک نوع اختلاف جدی مدیریتی با آقای احمدی نژاد دارم. مسائل استراتژیک کشور با تانی و حساب شده پیش برود و احتیاج دارد همه بخش های مختلف همگرایی داشته باشد. کارهای لحظه ای نمی تواند صدق کند و برای کشور مشکلاتی ایجاد می کند.»
وی گفته بود:«تا یک مدتی تحمل بود و بحث می کردیم اما از یک زمانی به بعد من دیدم به هرحال ایشان رئیس جمهور است و حق دارد و لزومی ندارد که بنده مزاحم ایشان باشم و نمی خواستم حضوری تحمیلی داشته باشم. در واقع سطح من این نبود»